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"Etude des potentialités de transfert des transgènes des plantes transgéniques aux bactéries du sol et de l’impact sur la communauté bactérienne" par Mayssaa Aljouda

Discipline : Biochimie et Biologie Moléculaire, Laboratoire : UMR 5005 - Laboratoire Ampère

Résumé :
Le transfert de gènes à partir de PGM vers les bactéries de sol a été détecté dans des conditions optimales en laboratoire, mais de tels évènements n’ont pas été rapportés pour les bactéries dans leur milieu naturel en plein champ. Ces résultats pourraient être dus à la faible fréquence de ces événements et au manque de sensibilité des techniques de détection. Une approche métagénomique a été utilisée dans ce travail afin de détecter les événements de transfert de gènes de PGM vers les bactéries de sol et d’évaluer l'impact possible de la culture PGM sur les bactéries dans les conditions du champ à l’aide d’outils novateurs et de grande sensibilité. La technologie Illumina n’a pas identifié de transfert d’ADN à partir de la vigne transgénique. Les techniques RISA et Microarrays taxonomiques ont révélé un effet léger des cultures PGM sur la composition des communautés bactériennes isolées du sol des parcelles, mais aucun impact n’a été détecté sur celles isolées des sols des serres.

Abstract:
Laboratory and greenhouse conducted experiments have shown that gene transfer events from transgenic plants to bacteria can happen but field trials failed to detect any in situ evidence. This may be due to the low frequency of these events but also to the lack of sensitivity of detection techniques. In our study, a metagenomic approach was used to detect gene transfer events from GMPs to soil bacteria and evaluate the possible impact of the cultivation of these plants on microbial communities under field conditions by using high sensitivity innovative tools. No molecular evidence of DNA transfer from transgenic grapevine was detected by Illumina sequencing. To evaluate the impact of transgenic grapevine on the bacterial community in greenhouse and field trials soils, RISA and taxonomic microarrays technologies were performed. A slight effect of GMPs crops on field bacterial communities was detected, but no impact was detected in greenhouse bacterial communities.

Informations complémentaires
Monsieur Yves Dessaux, Directeur de Recherche, ISV- UPR2355 CNRS- Institut des Sciences du Végétal, Gif sur Yvette – Rapporteur
Monsieur Claude Gaillardin, Professeur des Universités, AgroParisTech, Thiverval−Grignon – Rapporteur
Monsieur Francis Quetier, Professeur des Universités, Université d'Evry Val d'Essonne – Examinateur
Monsieur Pascal Simonet, Directeur de Recherche, UMR 5005 - Laboratoire Ampère, Ecully - Examinateur
Monsieur Olivier Lemaire, Directeur de Recherche, UMR - UDS Santé de la Vigne et Qualité du Vin, Colmar – Examinateur
Madame Sandrine Démanèche, Chargé de Recherche, UMR 5005 - Laboratoire Ampère, Ecully – Examinateur
Madame Francine Casse, Directeur de Recherche, CNRS−URA573-Laboratoire de Biochimie et Physiologie Végétales, Montpellier – Examinateur

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