Informations générales :

Domaine(s)	Sciences Technologies Santé
Mention(s)	Biologie - Santé
Discipline(s)	Biologie
Durée des études	4 semestres
Niveau(x) de recrutement	Licence de Biologie.
Composante(s)	UFR des Sciences
Ville(s)	Versailles
Formation en apprentissage	non
Langue(s) d'enseignement	Français

Le développement rapide de l’outil génomique résulte de sa capacité à poser de nouvelles questions scientifiques et à revisiter d’anciens sujets de recherche. Pourtant, sa vulgarisation ainsi que la complexité inhérente à son utilisation conduisent progressivement le scientifique à utiliser en l’état cet outil expérimental plus qu’à s’en approprier le principe méthodologique. Paradoxalement, l’efficacité d’une telle approche réside dans son développement et/ou son adaptation à la question posée. En conséquence, les trois poutres maîtresses sur lesquelles reposera notre formation seront 1) la maîtrise des outils expérimentaux, 2) l’acquisition de connaissances théoriques et méthodologiques et 3) la compréhension de la nécessaire adéquation entre la question posée et l’outil expérimental choisi pour y répondre.
Objectifs Scientifiques
La Génomique permet l’étude globale des fonctions biologiques et l’accumulation des séquences de nombreux génomes autorise une comparaison fonctionnelle de celles-ci. Les enseignements qui constituent notre formation auront donc pour double objectif de donner aux étudiants les connaissances actuelles issues de la recherche en Génomique ainsi que l’étude des contraintes évolutives qui s’appliquent sur les grandes fonctions biologiques.
Objectifs pédagogiques    
Les enseignements de ce Master, construit sur deux ans, ont pour but de donner aux étudiants 1) les bases conceptuelles indispensables de la Biologie « moderne » (Génomique, Microbiologie et Bioinformatique) et 2) la structure méthodologique nécessaire pour formuler une question par nature biologique en utilisant une approche scientifique.

Spécificités de la formation :

La pertinence d’une approche scientifique repose sur un principe méthodologique, une autonomie et une rigueur intellectuelle, et un bon esprit d’analyse. En outre, et s’agissant plus particulièrement de la Discipline Biologie, cette approche nécessite une bonne adresse expérimentale. L’acquisition de ces compétences s’effectue naturellement pendant la thèse mais également en amont de ce projet, au cours du Master. A cet effet, nous avons développé une approche combinée au travers de laquelle les étudiants acquièrent ces principes méthodologiques. Les étudiants doivent suivre une partie des enseignements sous la forme d’une initiation à la recherche encadrée par une équipe pédagogique et une équipe porteuse du projet proposé. Ce stage tire également un avantage pédagogique de l’utilisation des plateformes à grands instruments. Cette formation est labellisée par le PRES UniverSud. Actuellement, ces stages se déroulent sur la plateforme BioPuce Gif/Orsay (transcriptome), sur la plateforme Métabolomique du Moulon (INRA, UPS) ainsi que dans d’autres laboratoires (protéomique, ChIP on Chip, bioinformatique, métagénomique, , etc...). En complément pédagogique, une série de conférences est proposée aux étudiants. Les thèmes retenus concernent l’analyse haut débit en Biologie. Ces conférences mettent l’accent sur l’adéquation entre la question scientifique et l’outil choisi pour y répondre.

Compétences développées :

A l'issue du Master les étudiants devront avoir acquis les bases théoriques et techniques d'une démarche expérimentale scientifique leur permettant l'intégration dans une équipe de recherche. A l'issue de la formation, l'étudiant devrait être autonome pour la conduite et la réalisation d'un projet de recherche en Biologie-Santé.

Perspectives professionnelles :

Cette formation de Master conduit naturellement à la Recherche en Génomique, Microbiologie et Bioinformatique dans les instituts de recherche publics et privés (au niveau doctorat et post-doctorat) ainsi qu’au métier d’enseignants-chercheurs. Par ailleurs, les compétences acquises au cours de cette formation donneront, pour les diplômés qui le souhaitent, les qualifications nécessaires pour prétendre à un emploi d’ingénieur (Bioinformatique, Génie Biologique, Microbiologie appliquée, Pharmacogénomique et Génomique).

Conditions d'admission :

Master 1ère année :
Licence de Biologie ou équivalent.

Master 2ème année :
60 ECTS de Master de Biologie ou Maîtrise de Biologie ou équivalent
Etudiants de filières médicales titulaires d'une MSBM ou Diplôme d'ingénieur.
L'admission se fait après examen du dossier de candidature et entretien auprès de l'équipe pédagogique.

Formations requises :

Licence de Biologie.

Inscription :

M1 : Toutes les informations sont dans la rubrique www.uvsq.fr/inscriptions/
Inscription en mention Biologie.

M2 : sur dossier (pdf)
- avant le 31 mai 2010 pour les étudiants non titulaires d’une maîtrise française ou d’un Master 1 français (dossiers de validation d’études).
- avant le 15 juillet 2010 pour les étudiants de l'UVSQ ayant validé leur Master 1.
- avant le 31 août 2010 pour les titulaires d’une maîtrise française ou d’un Master 1 français hors UVSQ.

Tout étudiant étranger résidant à l'étranger doit se renseigner auprès de l'espace Campus France de son pays avant de faire une demande d'inscription dans notre établissement : http://www.campusfrance.org.

Formation continue :

Julien PERRAULT
Tél : 01 39 25 41 69
Fax : 01 39 25 42 57
julien.perrault@uvsq.fr

Contacts :

Adresse
UFR des Sciences
45 avenue des Etats-Unis 78035 Versailles Cedex
Standard : 01 39 25 41 12

Secrétariat pédagogique
Florence ARMAND
UFR DES SCIENCES
Département de Biologie
01 39 25 40 22
florence.armand@uvsq.fr

Direction de la Réussite et de l'Insertion Professionnelle (DRIP)
Service Information et Orientation
Tél : 01 39 25 46 10
orientation.vers@uvsq.fr

Enseignant responsable de la spécialité
M1 : Delphine SITTERLIN
Mél : delphine.sitterlin@uvsq.fr
M2 : Jean-Luc FERAT
Mél : ferat@cgm.cnrs-gif.fr.

Contenu de la formation :

Semestre 1

Unités d'enseignement obligatoires
Statistique, communication et anglais scientifique écrit - 45 h - 5 ECTS
Génétique du développement et de la différenciation - 45 h - 5 ECTS
Intégration des signaux dans la cellule - 45 h - 5 ECTS
Génomique comparée - 27 h - 3 ECTS

Unités d'enseignement optionnelles (2 UE au choix)
Reproduction et déterminisme du sexe - 54 h - 6 ECTS
Prolifération et mort cellulaire, oncogenèse - 80 h - 9 ECTS
Immunologie générale - 54 h - 6 ECTS
Base de données - 54 h - 6 ECTS


Semestre 2

Unités d'enseignement obligatoires
Stage 1 - 5 semaines - 12 ECTS 


Unités d'enseignement optionnelles (3 UE au choix)

MSBIO 207 - Agents infectieux et non conventionnels - 54 h - 6 ECTS
MSBIO 209 - Etude des interactions durables en milieux marins et terrestres (stage à l'observatoire de Banyuls-sur-mer) - 54 h - 6 ECTS
MSBIO 202 - Expression des génomes - 54 h - 6 ECTS
MSBIO 203 - Dynamique des génomes microbiens - 54 h - 6 ECTS
MSBIO 212 - Pharmacologie - 54 h - 6 ECTS
MSBIO - Nutrition, besoins nutritionnels et prévention des grandes pathologies et sécurité alimentaire - 54 h - 6 ECTS
MSBIO 205 - Longévité et vieillissement - 54 h - 6 ECTS
Biodiversité génomique - 27 h - 3 ECTS
MSBIO 214 - Bases de données - 54 h - 6 ECTS
Système dynamique en biologie - 54 h - 6 ECTS
Technologie des neurosciences - 54 h - 6 ECTS

Semestre 3

Unités d'enseignement obligatoires
Analyse expérimentale en Génomique (UVSQ, UPS, UniverSud Paris) - 54 h - 6 ECTS
Génomique fonctionnelle (UVSQ, UPS, UniverSud Paris) - 54 h - 6 ECTS
Interface Biologie/Bioinformatique (UVSQ) - 27 h - 6 ECTS

Unités d'enseignement optionnelles

Options orientées Genomique et Microbiologie
Organisation et Dynamique des Génomes (UVSQ, UPS) - 54 h - 6 ECTS
MSBIO307 - Interaction Microorganismes et Environnement (UVSQ, UEVE, UniverSud Paris) - 27 h - 3 ECTS
Analyse comparée des Genomes eucaryotes (UVSQ, UEVE) – 27 h – 3 ECTS
Adaptation des Virus et Agents non conventionnels à leur environnement (UVSQ) - 54 h - 6 ECTS
Génomique Métabolique (UEVE) – 27 h – 3 ECTS

Options orientées Bioinformatique
Analyse et Modélisation des Réseaux d’Interaction Biologiques (UVSQ) - 27 h - 3 ECTS
ARNomique et Bioinformatique de l’ARN (UPS) - 27 h - 3 ECTS
Bioinformatique Structurale (UPS) - 27 h - 3 ECTS
Statistique du Génome (UPS) – 27 h  - 3 ECTS


Semestre 4

Unités d'enseignement obligatoires
MSBIO 316 - Stage 2 - 6 mois (début janvier - fin juin) - 27 ECTS
Suivi de stage en Anglais - 27 h - 3 ECTS